Claude нашёл в ДНК фагов новую ферментную систему

Anthropic сообщила о первом результате своей биологической лаборатории: агенты на базе Claude нашли в геномных данных новую ферментную систему. Компания назвала её ART — обратные транскриптазы, связанные с массивами повторов. Она встречается у бактериофагов, вирусов, заражающих бактерии. Гипотезу предложила модель, а проверяли её уже исследователи в лаборатории.

Claude искал необычные сочетания генов в больших массивах ДНК и обратил внимание на ген обратной транскриптазы, рядом с которым расположены другой ген и длинная последовательность повторов. Такая архитектура отчасти напоминает CRISPR — природную систему защиты бактерий от вирусов, которую учёные приспособили для редактирования генов.

Эксперименты показали, что из найденного массива повторов образуются короткие РНК. Как именно работает ART, ещё предстоит выяснить.

В этом и заключается интересный переход от математики к биологии. В некоторых математических задачах ИИ уже помогает находить результаты, которые затем можно проверить кодом или доказательством — например, такой подход описан в работе об автономных математических открытиях. В молекулярной биологии тоже можно массово выдвигать гипотезы. Здесь окончательным «оракулом» становится эксперимент с живым материалом. Он медленнее и дороже вычислительной проверки — зато способен показать, скрывается ли за красивым узором в данных реальный механизм.

В молекулярной биологии окончательным «оракулом» становится эксперимент с живым материалом

Лаборатория Anthropic соединяет эти два этапа: модель сужает пространство поиска, люди проводят опыты и возвращают результаты в работу. OpenAI тоже испытывала такой цикл вместе с Red Queen Bio: модель предлагала изменения лабораторного протокола, а эксперименты выполняли исследователи партнёра. ART уже показывает, зачем ИИ нужен выход за пределы чата: там гипотезу можно проверить опытом.